育苗溫室大棚建設時施工過深，不光會增加了溫室圍墻的土方量，還需要大量的土堆放在大棚內，因此開挖越來越深，不利于蔬菜的生長。溫室之所以可以用來種植反季節蔬菜（瓜、茄子、水果和其他溫暖的蔬菜），是因為溫室大棚可以為它營造適宜的溫度和光照條件。這與溫室日復一日接收陽光、在溫室內儲存熱量、夜間散熱的“溫室效應”密切相關。
育苗溫室大棚建設挖得太深的危害主要有兩個方面：
一方面，不可規避地會導致大棚前出現一條長長的遮蔭帶。溫室內溫度（氣溫+地溫）受陽光照射而升高，陰涼區的蔬菜會因低溫而出現“低溫屏障”。同時，由于光照不足，蔬菜不能正常進行光合作用，導致“黃瘦”，甚至“餓死”。
另一方面，建設者利用大棚內的成熟土筑墻后，表面是一層有機質含量低、土壤中缺乏有益微生物、透氣性差的生土。如果不加以改造，將影響當季蔬菜的生長。另外， 育苗大棚建設下挖得太深，對于一些地下水位太淺的地區也不適合。如果大棚下的苗挖得太深，溫室里種植的黃瓜會脫根、枯樹，造成較大的經濟損失。墻的內外坡不宜太陡。
一是墻體的里面坡度過陡或無坡度，使墻體的總表面積減小，進而減少墻體在白天的蓄熱的能力。溫室溫度容易受影響，不利于蔬菜的正常生長發育。
二是東西墻的內坡太陡或沒有坡度，所以白天早晚工棚內的光線很容易被東西墻遮擋。擋墻的時間和面積隨擋墻坡度的減小而增加。溫室光照不足會影響蔬菜的光合作用，減少蔬菜的產量和品質。另外，苗木溫室墻的內外側都有坡度，墻體呈梯形，可以增加其大棚的結實度。
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